py-mmcif 是一个用于解析和处理 mmCIF 文件的 Python 库，常用于生物信息学中以获取蛋白质结构数据。pdbx_poly_seq_scheme 是 mmCIF 文件中的一个常见表格，它提供了多聚体序列相关的信息，比如原子序列编号、残基信息等等。

如果你使用 py-mmcif 包来解析 mmCIF 文件，并希望从中获取 pdbx_poly_seq_scheme 的内容，可以参考以下步骤：

1. 安装 py-mmcif 库：

   如果还没有安装 py-mmcif，可以使用 pip 来安装：

   pip install py-mmcif  

2. 解析 mmCIF 文件：

   使用 MMCIFParser 来解析 mmCIF 文件。假设你的文件名为 example.cif：

   from mmcif.io.PdbxReader import PdbxReader  
   # 打开文件并读取内容  
   with open('example.cif', 'r') as cif_file:  
      reader = PdbxReader(cif_file)  
      data = []  
      reader.read(data)  
   # 一般来说，mmCIF 文件只有一个数据块，取第一个即可  
   data_block = data[0]  

3. 获取 pdbx_poly_seq_scheme 内容：

   通过数据块可以访问不同的表格数据，获取 pdbx_poly_seq_scheme：

   # 获取 pdbx_poly_seq_scheme 表格  
   poly_seq_scheme = data_block.getObj('pdbx_poly_seq_scheme')  
   if poly_seq_scheme:  
      # 遍历所有条目  
      for i in range(poly_seq_scheme.getRowCount()):  
          # 获取特定行的信息  
          seq_id = poly_seq_scheme.getValue('seq_id', i)  
          mon_id = poly_seq_scheme.getValue('mon_id', i)  
          auth_seq_num = poly_seq_scheme.getValue('auth_seq_num', i)  
          pdb_strand_id = poly_seq_scheme.getValue('pdb_strand_id', i)  
          # 打印或处理信息  
          print(f"Seq ID: {seq_id}, Monomer ID: {mon_id}, Auth Seq Num: {auth_seq_num}, Strand ID: {pdb_strand_id}")  
   else:  
      print("pdbx_poly_seq_scheme 表格未找到")  

4. 解释数据：

• seq_id：序列标识符。
• mon_id：残基标识符（单体标识符）。
• auth_seq_num：根据 PDB 文件的权威序列编号。
• pdb_strand_id：对应于 PDB 中的链标识符。

通过这样的方式，你可以解析 pdbx_poly_seq_scheme 表格，并处理其中的生物分子序列信息。希望这可以帮助你更好地操作和理解 mmCIF 文件结构数据。